Hướng dẫn import tab delimited file into python pandas - nhập tệp được phân cách bằng tab vào pandas python

Tôi đã đọc một tệp dữ liệu được phân phối theo tab trong Windows với gấu trúc/python mà không có bất kỳ vấn đề nào. Tệp dữ liệu chứa ghi chú trong ba dòng đầu tiên và sau đó theo tiêu đề.

Show
df = pd.read_csv(myfile,sep='\t',skiprows=(0,1,2),header=(0))

Bây giờ tôi đang cố đọc tệp này với máy Mac của mình. (Lần đầu tiên tôi sử dụng Python trên Mac.) Tôi gặp lỗi sau.

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39

Nếu đặt đối số ERROR_BAD_LINES cho read_csv thành sai, tôi sẽ nhận được thông tin sau, tiếp tục cho đến khi kết thúc hàng cuối cùng.

Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39
Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125
...

Tôi có cần chỉ định một giá trị cho đối số mã hóa không? Có vẻ như tôi không nên làm vì đọc tệp hoạt động tốt trên Windows.

Bước 2: Áp dụng mã Python. ....

Bước 3: Chạy mã. ....

Bước tùy chọn: Chọn tập hợp con của các cột ..

thực đơn

Tìm kiếm toc more_vertCreating DataFrames Cookbook

Cảm ơn vì cảm ơn!

keyboard_voice

thực đơn

Tìm kiếm toc more_vert

Cảm ơn vì cảm ơn!
"Creating a table in MySQL"

gần"@append"

Chevron_left Tạo cuốn sách nấu ăn DataFrames"!dataframe"

Tìm kiếm"#python"

Mẹo tìm kiếm

Tìm kiếm một công thức: "Tạo bảng trong MySQL" to open search panel

Tìm kiếm tài liệu API: "@Append" to close search panel

Tìm kiếm mã: "! DataFrame" to navigate between search results

Áp dụng bộ lọc thẻ: "#Python"d to clear all current filters

Phím tắt hữu íchEnter to expand content preview

/ để mở bảng tìm kiếm

Hướng dẫn import tab delimited file into python pandas - nhập tệp được phân cách bằng tab vào pandas python

ESC đến bảng tìm kiếm gầnBeta

↑ Để điều hướng giữa các kết quả tìm kiếm

Hướng dẫn import tab delimited file into python pandas - nhập tệp được phân cách bằng tab vào pandas python

⌘d để xóa tất cả các bộ lọc hiện tại

⌘enter để mở rộng xem trước nội dung

Hướng dẫn import tab delimited file into python pandas - nhập tệp được phân cách bằng tab vào pandas python
Tìm kiếm tài liệu

Mã tìm kiếm beta

Tìm kiếm toc more_vertCreating DataFrames Cookbook

Cảm ơn vì cảm ơn!

chevron_right

gần

chevron_right

Chevron_left Tạo cuốn sách nấu ăn DataFrames

chevron_right

Tìm kiếm

Mẹo tìm kiếmJul 1, 2022

Tìm kiếm một công thức: "Tạo bảng trong MySQL"

Tìm kiếm tài liệu API: "@Append" PythonPandas

Tìm kiếm mã: "! DataFrame"

Áp dụng bộ lọc thẻ: "#Python"

expand_more

Phím tắt hữu ích

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39
0

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39
1

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39
2

/ để mở bảng tìm kiếm

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39
0

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39
5

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39
2

ESC đến bảng tìm kiếm gần

↑ Để điều hướng giữa các kết quả tìm kiếm

⌘d để xóa tất cả các bộ lọc hiện tại

⌘enter để mở rộng xem trước nội dung

Tìm kiếm tài liệu

Mã tìm kiếm beta/ to insta-search docs and recipes!

Tổng quan

Giảng dạy: 15 phút Bài tập: 5 phút 15 min
Exercises: 5 min

Câu hỏi

  • Pandas là gì?

  • Làm cách nào để đọc các tệp bằng gấu trúc?

  • Sự khác biệt giữa việc đọc các tệp sử dụng gấu trúc và các phương thức đọc tệp khác là gì?

Mục tiêu

  • Giải thích mô -đun là gì và cách chúng được sử dụng trong Python

  • Mô tả Thư viện phân tích dữ liệu Python (PANDAS) là gì

  • Tải Thư viện phân tích dữ liệu Python (PANDAS)

  • Sử dụng read_csv để đọc dữ liệu bảng vào python

Pandas là gì?

Làm cách nào để đọc các tệp bằng gấu trúc?

Sự khác biệt giữa việc đọc các tệp sử dụng gấu trúc và các phương thức đọc tệp khác là gì?

Mục tiêu

  • Giải thích mô -đun là gì và cách chúng được sử dụng trong Python
  • Mô tả Thư viện phân tích dữ liệu Python (PANDAS) là gì
  • Tải Thư viện phân tích dữ liệu Python (PANDAS)
  • Sử dụng read_csv để đọc dữ liệu bảng vào python
  • Pandas là một thư viện Python chứa một tập hợp các chức năng và cấu trúc dữ liệu chuyên dụng đã được thiết kế để giúp các lập trình viên Python thực hiện các tác vụ phân tích dữ liệu theo cách có cấu trúc.
  • Hầu hết những điều mà gấu trúc có thể làm có thể được thực hiện với Python cơ bản, nhưng tập hợp các hàm gấu trúc và cấu trúc dữ liệu được thu thập làm cho các tác vụ phân tích dữ liệu phù hợp hơn về mặt cú pháp và do đó hỗ trợ cho khả năng đọc.
  • Các tính năng đặc biệt của gấu trúc mà chúng ta sẽ xem xét về điều này và một vài tập tiếp theo bao gồm:

Đọc dữ liệu được lưu trữ trong các tệp CSV (các định dạng tệp khác cũng có thể được đọc)

Cắt và tập hợp dữ liệu trong DataFrames (Bảng!)

Xử lý dữ liệu bị thiếu

Định hình lại dữ liệu (dài -> rộng, rộng -> dài)

Chèn và xóa các cột khỏi cấu trúc dữ liệu

Tổng hợp dữ liệu bằng cách sử dụng các cơ sở nhóm dữ liệu bằng cách sử dụng mô hình-bombine phân chia

Tham gia bộ dữ liệu (sau khi chúng được tải vào DataFrames)

Nếu bạn đang tự hỏi tại sao tôi viết gấu trúc với chữ thường ‘P, thì đó là tên của gói và Python là trường hợp nhạy cảm.

Nhập thư viện Pandas

Nhập thư viện Pandas được thực hiện theo cách chính xác giống như đối với bất kỳ thư viện nào khác. Trong hầu hết các ví dụ về mã Python sử dụng thư viện Pandas, nó sẽ được nhập và đưa ra bí danh là

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39
7. Chúng tôi sẽ tuân theo cùng một quy ước.

Cấu trúc dữ liệu gấu trúc

Đối với các ví dụ của chúng tôi trong tập này, chúng tôi sẽ sử dụng tệp SN7577.TAB. Điều này có sẵn để tải xuống tại đây và mô tả của tệp có sẵn tại đây

Chúng tôi sẽ đọc trong tệp SN7577.TAB của chúng tôi. Mặc dù đây là tệp được phân định tab, chúng tôi vẫn sẽ sử dụng phương thức Pandas

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39
8, nhưng chúng tôi sẽ nói rõ phương thức rằng dấu phân cách là ký tự tab chứ không phải dấu phẩy mặc định.

df_SN7577 = pd.read_csv("SN7577.tab", sep='\t')

Tập thể dục

Điều gì xảy ra nếu bạn quên chỉ định

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39
9 khi đọc bộ dữ liệu được phân định tab

Dung dịch

df_SN7577_oops = pd.read_csv("SN7577.tab")
print(df_SN7577_oops.shape)
print(df_SN7577_oops)

Nếu bạn cho phép gấu trúc giả định rằng các cột của bạn được phân tách bằng dấu phẩy (mặc định) và có không, thì mỗi bản ghi sẽ được coi là một cột duy nhất. Vì vậy, hình dạng được cho là 1286 hàng (đúng) nhưng chỉ có một cột. Khi nội dung được hiển thị, tên cột duy nhất là bản ghi đầu tiên hoàn chỉnh. Lưu ý

Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39
Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125
...
0 được sử dụng để biểu thị các ký tự tab trong đầu ra. Đây là cùng một định dạng chúng tôi đã sử dụng để chỉ định bộ phân tách tab khi chúng tôi đọc chính xác trong tệp.

Nhận thông tin về DataFrame

Bạn có thể tìm ra loại biến

Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39
Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125
...
1 bằng cách sử dụng hàm
Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39
Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125
...
2.


Bạn có thể thấy nội dung bằng cách nhập tên biến. Bạn có thể thấy từ đầu ra rằng nó là một định dạng bảng. Các tên cột đã được lấy từ bản ghi đầu tiên của tệp. Ở phía bên trái là một cột không có tên. Các mục ở đây đã được cung cấp bởi gấu trúc và hoạt động như một chỉ mục để tham chiếu các hàng riêng lẻ của DataFrame.

Hàm

Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39
Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125
...
3 có tham số
Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39
Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125
...
4 mà bạn có thể sử dụng để cho biết các cột nào trong tệp bạn muốn sử dụng làm chỉ mục thay thế. Vì bộ dữ liệu SN7577 không có một cột xác định duy nhất mỗi hàng chúng tôi không thể làm điều đó.

Một điều khác cần chú ý về màn hình là nó bị cắt ngắn. Theo mặc định, bạn sẽ thấy 30 hàng đầu tiên và cuối cùng. Đối với các cột, bạn sẽ luôn nhận được một vài cột đầu tiên và điển hình là một vài cột cuối cùng tùy thuộc vào không gian hiển thị.

Thông tin tương tự có thể thu được với

Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39
Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125
...
5 nhưng ở đây bạn chỉ được trả lại 5 hàng đầu tiên theo mặc định.

Tập thể dục

  1. Điều gì xảy ra nếu bạn quên chỉ định
    pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
    fields in line 8, saw 39
    
    9 khi đọc bộ dữ liệu được phân định tab
  2. Dung dịch

Nếu bạn cho phép gấu trúc giả định rằng các cột của bạn được phân tách bằng dấu phẩy (mặc định) và có không, thì mỗi bản ghi sẽ được coi là một cột duy nhất. Vì vậy, hình dạng được cho là 1286 hàng (đúng) nhưng chỉ có một cột. Khi nội dung được hiển thị, tên cột duy nhất là bản ghi đầu tiên hoàn chỉnh. Lưu ý

Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39
Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125
Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125
...
0 được sử dụng để biểu thị các ký tự tab trong đầu ra. Đây là cùng một định dạng chúng tôi đã sử dụng để chỉ định bộ phân tách tab khi chúng tôi đọc chính xác trong tệp.

# How many rows?
print(len(df_SN7577))
# How many rows and columns - returned as a tuple
print(df_SN7577.shape)
#How many 'cells' in the table
print(df_SN7577.size)
# What are the column names
print(df_SN7577.columns)
# what are the data types of the columns?
print(df_SN7577.dtypes)

1286
(1286, 202)
259772
Index(['Q1', 'Q2', 'Q3', 'Q4', 'Q5ai', 'Q5aii', 'Q5aiii', 'Q5aiv', 'Q5av',
       'Q5avi',
       ...
       'numhhd', 'numkid', 'numkid2', 'numkid31', 'numkid32', 'numkid33',
       'numkid34', 'numkid35', 'numkid36', 'wts'],
      dtype='object', length=202)
Q1             int64
Q2             int64
Q3             int64
...
Length: 202, dtype: object

Tập thể dục

Điều gì xảy ra nếu bạn quên chỉ định

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 1
fields in line 8, saw 39
9 khi đọc bộ dữ liệu được phân định tab

Dung dịch

for name in df_SN7577.columns:
    print(name)

Nếu bạn cho phép gấu trúc giả định rằng các cột của bạn được phân tách bằng dấu phẩy (mặc định) và có không, thì mỗi bản ghi sẽ được coi là một cột duy nhất. Vì vậy, hình dạng được cho là 1286 hàng (đúng) nhưng chỉ có một cột. Khi nội dung được hiển thị, tên cột duy nhất là bản ghi đầu tiên hoàn chỉnh. Lưu ý Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39 Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125 Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125 Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125 Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125 Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125 Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125 Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125 Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125 Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125 ... 0 được sử dụng để biểu thị các ký tự tab trong đầu ra. Đây là cùng một định dạng chúng tôi đã sử dụng để chỉ định bộ phân tách tab khi chúng tôi đọc chính xác trong tệp.

  • Nhận thông tin về DataFrame

  • Bạn có thể tìm ra loại biến

    Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39
    Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125
    ...
    
    1 bằng cách sử dụng hàm
    Skipping line 8: expected 1 fields, saw 39
    Skipping line 9: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 10: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 11: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 12: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 13: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 14: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 15: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 16: expected 1 fields, saw 125
    Skipping line 17: expected 1 fields, saw 125
    ...
    
    2.

  • Bạn có thể thấy nội dung bằng cách nhập tên biến. Bạn có thể thấy từ đầu ra rằng nó là một định dạng bảng. Các tên cột đã được lấy từ bản ghi đầu tiên của tệp. Ở phía bên trái là một cột không có tên. Các mục ở đây đã được cung cấp bởi gấu trúc và hoạt động như một chỉ mục để tham chiếu các hàng riêng lẻ của DataFrame.

Làm cách nào để đọc một tệp được phân định tab trong Python?

Để đọc các tệp giá trị được phân tách bằng tab với Python, chúng tôi sẽ tận dụng thực tế rằng chúng tương tự như CSV. Chúng tôi sẽ sử dụng thư viện CSV của Python và bảo nó chia mọi thứ với các tab thay vì dấu phẩy. Chỉ cần đặt đối số Delimiter thành "\ t". Đó là nó!set the delimiter argument to "\t" . That's it!

Làm cách nào để đọc một tệp được phân định trong gấu trúc?

Nếu bạn có một tệp văn bản với dấu phân cách dấu phẩy, hãy sử dụng pandas.read_csv () và để đọc tệp tab delimiter (\ t) sử dụng read_table ().Bên cạnh đó, bạn cũng có thể sử dụng đường ống hoặc bất kỳ dấu phân cách/phân tách tùy chỉnh nào. read_csv() and to read tab delimiter (\t) file use read_table(). Besides these, you can also use pipe or any custom delimiter/separator.

Làm cách nào để chuyển đổi một tab văn bản được phân tách thành CSV trong gấu trúc?

Nhập các mô -đun gấu trúc và numpy.Tạo DataFrame bằng phương thức DataFrame ().Lưu DataFrame dưới dạng tệp CSV bằng phương thức TO_CSV () với tham số SEP dưới dạng \ tiêu.Tải tệp CSV mới được tạo bằng phương thức read_csv () dưới dạng dataFrame.

Làm cách nào để tải một tệp vào gấu trúc?

Các bước để nhập tệp CSV vào Python bằng Pandas..
Bước 1: Chụp đường dẫn tệp.Đầu tiên, chụp toàn bộ đường dẫn nơi tệp CSV của bạn được lưu trữ.....
Bước 2: Áp dụng mã Python.....
Bước 3: Chạy mã.....
Bước tùy chọn: Chọn tập hợp con của các cột ..